逍遥月如来到扬州城,打败女飞贼后离开(建议此处练级),经过蟾蜍洞打死拦路的柳媚娘离开(蟾蜍身体里有五毒珠)。在一处小酒馆内与被剑圣抓走的灵儿后,来到京城。
回到圣姑家,逍遥的女儿终于安全出生了,灵儿和逍遥为了纪念月如给女儿取了忆如这个名字,灵儿和逍遥把忆如寄放圣姑家后,来到了大理.此时的大理因为受黑苗教主拜月的控制已经大旱几年了。灵儿身为黑苗公主用五颗灵珠求雨,成功后大家欢庆时,,拜月的地魔兽突然出现,随之而来是一个无底深渊。
游戏开始于余杭镇一个小客栈.南盗侠夫妇之子李逍遥,在客栈内赶走一个乞酒喝的破道士并约定在十里坡传授剑术后,婶婶突然患病昏迷.为治婶婶的病,他欲上仙灵岛求仙药,得到3个苗人赠与的破天锤,并喝下望忧散.来到仙灵岛,用破天锤打碎修罗石像后,懈逅正在沐浴的少女赵灵儿,并取得灵药.无奈灵儿姥姥(一只蛇妖)回来,误认为逍遥欺负灵儿,逼迫二人成亲。
逍遥为救婶婶,清晨拿着仙药紫金丹离开.婶婶苏醒后,逍遥先前所服望忧散发作,失去了从仙灵岛拿药回来的全部记忆.半夜去十里坡学剑回来,在客栈二楼见到被绑(架)的灵儿,二人同回仙灵岛,发现姥姥已死.李逍遥的婶婶得知二人已成亲后,令逍遥带灵儿去黑苗找她母亲(巫后)。二人搭顺风船来到苏州。
在苏州城门外,二人遇见刁蛮少女林月如。李逍遥为救一对私奔男女打败月如,将其绑于树上.后月如遇到流氓袭击,逍遥灵儿救她后,她为面子将逍遥刺伤后逃窜。灵儿拼死救活逍遥,二人进城。
二人为找灵儿随酒剑仙来到蜀山,进入锁妖塔见到被锁于剑柱上,现出原形的灵儿.逍遥记忆复苏,灵儿原是女娲后人.三人合力打败镇受锁妖塔的镇狱明王,破坏七根剑柱(七条不同属性的龙)后,锁妖塔坍塌.月如不幸牺牲。
逍遥在圣姑家醒来,方知自己已经在白苗国都大理城下。圣姑为了给灵儿做保胎药,需要麒麟角和凤凰蛋壳,并说要找到36个傀儡虫救月如,在找凤凰蛋壳时,逍遥邂逅了调皮可爱的阿奴,在阿奴的帮助下找到麒麟角,凤凰蛋壳(获得风,火灵珠)逍遥回到十年前,见到了灵儿的母亲巫后。了解了黑苗教主拜月想要训练水魔兽以统治苗人的阴谋,巫后与水魔兽同归于尽后,逍遥帮助她的侍女(灵儿的姥姥)将小时的灵儿送到仙灵岛并与小时的逍遥换的水灵珠后回到现实。二人帮助桃花村的桃树精们打败了妖怪,找全了36个傀儡虫。
魔兽消失了,大水也退了,但灵儿不再出现。不久李逍遥与阿奴告别,独自离开了苗疆。阿奴送走了逍遥,也送走了她的心。月如得圣姑以傀儡虫复生,抱着初生的忆如,等待李逍遥和灵儿归来。
杀掉隐龙窟里的蛇妖后没有灵儿的下落。二人遂放出里面的一群少女,并来到小镇摆到桌面上白河村。在村长兼大夫韩医仙家遇见灵儿。此时她已怀有身孕,但因不想逍遥知道且身体虚弱而假装昏迷。逍遥与月如分头取药将她治好。三人为报答韩医仙除掉了一个佛珠幻化的和尚,和黑水镇的尸妖(获得土灵珠)。回来后发现韩医仙女儿被苗人掳走,于是来到鬼阴山。灵儿为救其他两人跟随苗人石长老离开。
进城后在一间客栈内救出被群殴的书生刘晋元.逍遥与他长谈一夜,以为知己,早晨陪灵儿去玩,碰见月如比武招亲,,逍遥上擂台打败她后被要求入赘林家。刘晋元(月如表哥)和逍遥坚决反对。半夜,,灵儿女娲后人的特征显露出来(变成一只蛇妖),不知实情的逍遥以为灵儿被掳走,和月如一起追至隐龙窟。
穿过地底通道到达地底王宫。从地底王宫进入王宫大殿,看到巫王独自坐在王座上,巫王要将王位让给灵儿,并原谅他的行为。话没说完,拜月教主就出来制止。李逍遥打败他派出的殿前武士,巫王突然偷袭灵儿,使她受了重伤。原来巫王早已被拜月教主害死,这个巫王是妖怪乔装而成。李逍遥和阿奴杀掉这个装扮成巫王的妖怪后,阿奴留下来为灵儿疗伤,李逍遥则在王宫入口处追上拜月教主。拜月教主承认水灾和旱灾均是他一手操纵,他要率领魔兽征服天下。这时灵儿和阿奴也赶到,三人合力将拜月教主打倒。拜月教主投水,与水魔兽合体,引发大水,将李逍遥和阿奴冲走,BT页游私服,只有灵儿飞身上前与水魔兽决战。
月如的云姨家真豪华。二人在尚书府中见到月如表哥刘晋元。他已与身世不明的少女彩依成亲,且身患不明疾病,需每天服药才能苏醒。逍遥月如怀疑彩依有问题,请道士来除妖,意外见到教逍遥剑法的破道士酒剑仙。酒剑仙在府中作法神游。心急的月如独自去找彩依,逍遥赶到,急于采药的彩依逃跑。二人尾随,见到元凶黑蜘蛛一只,苦战时酒剑仙赶到助阵(获得雷灵珠)。原来彩依是蝴蝶幻化而成,为报答刘晋元的救命之恩才舍身相救。无奈刘晋元身中毒丝之毒,彩依用千年道行救了他,化成蝴蝶飞去......留下的只有一段回忆。