本作的主人公是一名居住在边境的西特罗村的男孩，他加入了当地的自警团。某一天，他在森林遗迹里发现了一本奇怪的书。仅仅是触摸了书本就让自己的脑海里出现了自己从来没有经历过的回忆，而且还获得了一种奇怪的力量。到底这本书会是怎么回事呢……？

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　　相对以往系列中，有大量变化的本作最新开场会是如何呢？又会有什么新角色追加呢？

　　为了解开书本的迷题，主人公遇见了兰布鲁族的赫兹巴。兰布鲁族是一种在世界各地旅行的商人一族，不论是各种情报还是知识都非常丰富。赫兹巴让主人公前往北方的塞那斯大图书馆里去寻找相关的情报。或许，那里可能会找到书本真实的情报。

　　KONAMI即将于2008年12月18日发售的RPG最新作品《幻想水浒传：十二宫》公开了一些最新情报，在本作中，《幻想水浒传》系列里的象征“纹章”将不存在，bt网页游戏sf，而换为“星之印”登场。同时各个角色的武器也变得可以自由更换了。